Computer Science in Chemistry

2024/2025

Academic Year

RUS

Instruction in Russian

6

ECTS credits

Delivered at:

Joint Department of Organic Chemistry with the RAS Zelinsky Institute of Organic Chemistry

Course type:

Compulsory course

When:

1 year, 1-4 module

Instructor

Svitanko, Igor

Программа дисциплины

Аннотация

Дисциплина "Информационные технологии в химии" состоит из следующих разделов: Ознакомление с современными информационными технологиями, их использованием в практике научного исследования и анализа данных. Подробности технического оснащения вычислительного комплекса. Применение вычислительных методов в химии - примеры из научной практики: расчет свойств и определение структуры молекулярных систем, моделирование поведения молекул, планирование синтеза. Освоение практических навыков эффективной работы с массовым и научным программным обеспечением. Обучение студентов самостоятельной подготовке результатов своих исследований к публикации; расширение систематических знаний по информационным технологиям и их прикладное применение. Презентация результатов в виде устных докладов, постеров, статей. Научная графика (проходит связующим звеном по всему курсу): представление информации в виде научной статьи в требуемых форматах, компоновка научного текста со всеми его элементами. Химическая графика.

Цель освоения дисциплины

• Целями освоения дисциплины «Информационные технологии в химии» являются: • ознакомление с современными информационными технологиями, их применением для практики проведения научного исследования и анализа данных; • обучение студентов самостоятельной подготовке результатов своих исследований к публикации; • расширение систематических знаний по информационным технологиям и их прикладное применение; • освоение практических навыков эффективной работы с массовым и научным программным обеспечением.

Планируемые результаты обучения

• Демонстрирует знание базовых принципов применения вычислительной техники и программного обеспечения (ПО) в химии.
• Демонстрирует знание текстовых редакторов, электронных таблиц и систем подготовки презентаций в химии.
• Умеет: • использовать вспомогательные программы: утилиты, архиваторы, антивирусное ПО; • производить необходимые расчеты в электронных таблицах, строить диаграммы и графики; • создавать презентации в среде PowerPoint; • самостоятельно разрабатывать Web-страницы.
• Умеет: • использовать графический интерфейс, проводить настройку ОС Windows; • подбирать и конфигурировать аппаратное обеспечение современного компьютера в зависимости от поставленной задачи; • анализировать строение и назначение локальных сетей и Интернета.
• Умеет: • подготавливать графические файлы в зависимости от их назначения; • оформлять химические тексты любой категории сложности на основе современных стандартов

Содержание учебной дисциплины

• Раздел 1. Вычислительные методы в химии. Устройство компьютера. Операционные системы. Способы передачи информации. Вредоносные программы. Общеупотребимое ПО. Способы форматирования текста.
• Раздел 2. Текстовые редакторы. MSWord и альтернативы. Комплект MSOffice. Таблицы и графики. Презентации. Рисование химических структур. Конечные форматы представления научного материала.
• Раздел 3. Научная графика. Конечные форматы представления научной информации-2.
• Раздел 4. Базы данных в химии

Элементы контроля

• Homework
  Домашние задания
• Practice work
  Групповая работа по моделированию свойства неизвестного вещества
• Экзамен №1
• Контрольная по научной графике
• Экзамен №2

Промежуточная аттестация

• 2024/2025 2nd module
  0.3 * Homework + 0.1 * Homework + 0.2 * Practice work + 0.4 * Экзамен №1
• 2024/2025 4th module
  0.2 * Homework + 0.25 * Homework + 0.25 * Контрольная по научной графике + 0.3 * Экзамен №2

Список литературы

Рекомендуемая основная литература

• Кувшинов, Н. С., Инженерная и компьютерная графика. : учебник / Н. С. Кувшинов, Т. Н. Скоцкая. — Москва : КноРус, 2017. — 233 с. — ISBN 978-5-406-05308-9-I-2016. — URL: https://book.ru/book/920561 (дата обращения: 27.08.2024). — Текст : электронный.

Рекомендуемая дополнительная литература

• Введение в хемоинформатику. Ч . 5: Информатика химических реакций, , 2017
• Введение в хемоинформатику. Ч. 1: Компьютерное представление химических структур, , 2013
• Введение в хемоинформатику. Ч. 2: Химические базы данных, , 2015
• Введение в хемоинформатику. Ч. 4: Методы машинного обучения, , 2016
• Введение в хемоинформатику. Ч. 6: Химическое пространство и виртуальный скрининг, , 2019
• Введение в хемоинформатику. Ч.3: Моделирование "структура - свойство", , 2015

Авторы

• Постриганова Анастасия Владимировна
• Медведев Михаил Геннадьевич
• Свитанько Игорь Валентинович