Bioinformatics

2024/2025

Academic Year

RUS

Instruction in Russian

6

ECTS credits

Delivered at:

Joint Department with RAS Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry

Course type:

Compulsory course

When:

2 year, 3, 4 module

Instructors

Zhiyanov, Anton

Рюмина Екатерина Даниловна

Программа дисциплины

Аннотация

Биоинформатика — современное направление на стыке множества наук, в рамках которого биологические процессы и явления исследуются методами прикладной математики, статистики и информатики. Широкому развитию данной науки во многом поспособствовало появление биологических экспериментов, ручная обработка результатов которых не представляется возможной в виду огромного объема получаемых данных. В рамках первой части курса слушатели узнают о задаче выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и методах ее решения. Алгоритмы из данной области являются мощным инструментом как для эволюционной биологии и филогенетики, так и для решения частых технических задач (например, подбор праймеров для ПЦР). Во второй части курса слушатели узнают о способах обработки данных секвенирования нового поколения, на сегодняшний день являющегося одним из самых широко используемых методов. Будут разобраны идеи алгоритмов сборки геномов и картирования прочтений, а особое внимание будет уделено данным секвенирования РНК. Последняя часть курса будет посвящена алгоритмам машинного обучения и их применению в биомедицине (с акцентом на данные транскриптомного анализа).