Данный проект Программы разработан на основании Распоряжения Правительства Российской Федерации от 12 августа 2008 г. № 1177-р. Первый вариант Программы рассматривался и был принят за основу на конференции трудового коллектива ГУ-ВШЭ в июне 2008 года. Программа согласована Министерством экономического развития Российской Федерации и Министерством образования и науки Российской Федерации. В настоящее время Программа проходит согласование в Министерстве финансов Российской Федерации.
Программа развития Государственного университета — Высшей школы экономики на период 2009–2015 гг. и до 2020 г.