Подходы глубинного обучения для изучения белок-белковых взаимодействий

ФИО студента: Гаврилова Алина Сергеевна

Кампус/факультет: Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова

Программа: Прикладная математика (Бакалавриат)

Год защиты: 2024

Базовые модели, которые широко используются в обработке естественного языка, постепенно начинают набирать популярность и в других областях, включая геномику. Пространство нуклеотидных последовательностей может стать потенциальным источником информации, которая расширит представления о болезнях и способах борьбы с ними. При обучении базовых моделей используются обширные наборы данных, а в дальнейшем такие модели могут быть адаптированы для решения конкретных задач. Этот подход позволяет значительно сократить количество ресурсов, которые потребовались бы для обучения модели с нуля. Данное исследование посвящено изучению возможностей моделей HyenaDNA, GENA-LM и Nucleotide Transformer, предварительно обученных на геномных данных. Они будут применены в задаче бинарной классификации, цель которой - научиться отличать Z-флипоны от случайных последовательностей ДНК.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ