Предсказание побочных эффектов вакцинации Спутником V на основе генетических данных

Введение: Вакцинация от COVID-19 российской вакциной Спутник V доказала свою эффективность в предотвращении распространения и тяжёлого течения заболевания SARS-COV2, однако она может вызывать различные побочные эффекты, варьирующиеся в зависимости от индивидуальных характеристик, в том числе генетической предрасположенности. Методы: Мы провели полногеномный поиск ассоциаций для ухудшения самочувствия после вакцинацией Спутником V, оцениваемого на основе опросника, по генетическим данным мультиэтнической когорты из 20 825 вакцинировавшихся (7 910 случаев, 12 915 контролей). Все образцы генотипировались микрочипом Illumina GSA v3. После этого мы провели анализ HLA-гаплотипов. Результаты: Наше исследование показало сильную ассоциацию между мутациями в генах HLA-DQA1, HLA-DRB1, HLA-B, HLA-DRA, HLA-C и реакцией на вакцинацию Спутником V. Мы также выявили 14 конкретных HLA-аллелей, повышающих или понижающих риск ухудшения самочувствия после вакцинации. Среди самых значимых протективных аллелей были DRB1*03:01 (OR 0.84, p-value 9.76E-11), DQA1*05:01 (OR 0.83, p-value 2.01E-11) и DQB1*02:01 (OR 0.84, p-value 2.69E-11), которые вместе известны как тип DR3-DQ2, ассоциированный с дибетом 1-го типа и целиакией. Другими протективными аллелями были В*08:01 (OR 0.82, p-value 4.01E-11), B*07:02 (OR 0.91, p-value 3.14E-5), C*07:01 (OR 0.91, p-value 1.03E-5), C*07:02 (OR 0.91, p-value 5.72E-6). Увеличивающими риск аллелями были DRB1*04:02 (OR 1.24, p-value 1.92E-4), B*44:03 (OR 1.18, p-value 3.74E-5), DQA1*02:01 (OR 1.17, p-value 1.86E-14), DQB1*02:02 (OR 1.17, p-value 6.02E-12), DRB1*07:01 (OR 1.17, p-value 4.99E-14), B*13:02 (OR 1.13, p-value 1.35E-4) и C*06:02 (OR 1.11, p-value 4.47E-6). Выводы: Мы выполнили первый полногеномный поиск ассоциаций для реакции на вакцинацию Спутником V. Наше исследование подчёркивает ключевую роль генов HLA в формировании разнообразия реакции на вакцину. Знание конкретных HLA-аллелей, повышаюших или понижающих риск побочных реакций, может быть интегрировано в клиническую практику для персонализированного подбора вакцины.