• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Оптимизация условий культивирования и подбор штамма-продуцента для повышенной экспрессии рекомбинантного фрагмента капсидного белка цирковируса

ФИО студента: Ахременко Дарья Дмитриевна

Руководитель: Князев Евгений Николаевич

Кампус/факультет: Факультет биологии и биотехнологии

Программа: Клеточная и молекулярная биотехнология (Бакалавриат)

Год защиты: 2024

Цирковирус свиней 2-го типа (ЦВС2) - инфекционное вирусное заболевание, наносящее значительный ущерб животноводству. Вирус поражает иммунную систему поросят, делая их более восприимчивыми к другим заболеваниям. Внедрение программ ветеринарного контроля и вакцинация являются эффективными методами предотвращения распространения данной инфекции. Основным компонентом коммерческих вакцин является рекомбинантный капсидный белок цирковируса, кодируемый геном orf2. Основной белок капсида цирковируса (ORF2) необходим для сборки вирусной частицы и является ключевой мишенью для иммунной системы. В данной дипломной работе основное внимание уделено разработке и оптимизации методов получения рекомбинантного капсидного белка на примере полноразмерного ORF2 с сигналом ядерной локализации в системе экспрессии бактерий Escherichia coli. Целью данной научной работы является разработка эффективных методов производства белка ORF2 путем создания высокопродуктивного штамма-продуцента рекомбинантного белка, а также подбор и оптимизация условий культивирования. В процессе исследования были подобраны оптимальные условия культивирования штамма E. coli Rosetta (DE3), для получения целевого продукта преимущественно в тельцах включения - культивирование на среде LB при 40°C, индукция 1 мМ ИПТГ при ОП590= 1,0. Выходы белковой продукции составили 120 мг/л. Для проведения дальнейшего анализа был подобран штамм Clear coli BL21(DE3) с видоизмененными липополисахаридами (ЛПС), что позволяет безопасно использовать продуцента для получения вирусных вакцин. Была выбрана оптимальная плазмида с геном orf2, адаптированным под систему экспрессии в E. coli. Условия для индукции были подобраны на основе высокой продукции целевого белка в тельцах включения. Результатом работы стало определение оптимальных параметров культивирования для разрабатываемого вакцинного препарата против цирковируса свиней. Выходы порядка 120 мг/л были достигнуты при культивировании в течение 18 часов, с концентрацией ИПТГ 0,2 мМ, ОП590 0,7 и температуре культивирования 40°C. В процессе исследования были разработаны две вспомогательные конструкции: pArg2 с генами аргинин-аминоацил-тРНК и pArgS с геном argS – аргинил-тРНК синтетазы. Целью этих конструкций было увеличение выхода целевого белка ORF2. Наличие плазмиды pArgS не оказало влияния на выход белковой продукции, в то время как плазмида pArg2 способствовала увеличению продукции капсидного белка ORF2. Однако было выявлено, что наличие обеих конструкций замедляет скорость роста бактериальных клеток. Оптимальные условия культивирования без использования вспомогательных конструкций приводят к повышенному выходу белка. Тем не менее, использование указанных вспомогательных конструкций может быть целесообразным при получении белков с высоким содержанием аминокислоты аргинин. Наиболее эффективным методом для получения целевого продукта оказалось использование автоиндукции в питательной среде TB без добавления лактозы. Этот метод позволил достичь максимальных выходов исследуемого полноразмерного и тестового укороченного варианта (без сигнала ядерной локализации) ORF2 – 240 мг/л и 500 мг/л соответственно. Использование автоиндукции является удобным и практичным методом, который можно эффективно использовать при масштабировании производства и постановке ферментации.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ