• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Анализ экспрессии изоформ микроРНК в молекулярных подтипах рака молочной железы

ФИО студента: Карпова Лариса Александровна

Руководитель: Шкурников Максим Юрьевич

Кампус/факультет: Факультет биологии и биотехнологии

Программа: Клеточная и молекулярная биотехнология (Бакалавриат)

Оценка: 8

Год защиты: 2024

В процессе биогенеза гены микроРНК транскрибируются с помощью РНК-полимеразы II, образуя первичную микроРНК, которая претерпевает эквивалентность с ферментом Дроша. Далее Dicer обрабатывает молекулы с образованием пре-миРНК. На 5’-конце микроРНК находится специальный регион (семенной регион) на позициях 2–7, комплементарный целевой мРНК. В составе комплекса miRISC микроРНК взаимодействует с мРНК и вызывает ее деградацию непосредственно, либо привлекая другие белки. Альтернативное разделение Дроши и Дайсера приводит к образованию изоформ микроРНК (изомиР) с различными 5’- и/или 3’-концами. Нематричные модификации также являются источниками изоформ. Было показано, что информация о наличии или отсутствии изоформы микроРНК позволяет существовать 32 типам опухолей. Также установлено, что характер экспрессии изомиР может лучше отличать опухоль от нормальной ткани молочной железы, чем характер микроРНК. IsomiR также способен обнаруживать и характеризовать на молекулярном уровне подтипы люминальный А и люминальный. В ходе работы мы проанализировали 1186 образцов из проекта TCGA-BRCA. С помощью Recursive Feature Elimination произведен отбор isomiR, который позволяет классифицировать клетки на молекулярные подтипы молочной железы. Также был обучен классификатор и получена классификация. В ходе работы мы установили, что образец экспрессии изоформ микроРНК позволяет хорошо разделять белки (AUC-ROC = 0,96) на молекулярные подтипы, а также определять здоровые ткани.

Текст работы (работа добавлена 20 мая 2024 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ