Создание синтетических промоторов для РНК-полимеразы III

В последние годы лекарственные препараты на основе РНК-интерференции успешно проходят клинические испытания и выходят на рынок. Главная сложность при разработке таких препаратов – их эффективная доставка в мишень для обеспечения безопасной и таргетной терапии. Один из способов решения данной проблемы – это создание препаратов на основе векторов с shRNA и тканеспецифичным промотором для РНК-полимеразы III. Такой подход позволит уменьшить риск возникновения побочных эффектов, повысит стабильность и точность препаратов на основе РНК-интерференции. Тканеспецифичность промотора для РНК-полимеразы III не известна. Однако структура этого промотора схожа со структурой промотора для РНК-полимеразы II, что позволяет предположить наличие схожих механизмов взаимодействия факторов транскрипции, а значит появляется возможность использовать данные о тканеспецифичности этих факторов для промотора РНК-полимеразы III. Для получения тканеспецифичных промоторов для РНК-полимеразы III в данной работе был реализован инструмент, позволяющий картировать и оптимизировать существующие промоторы для РНК-полимеразы III, а также выполнять сборку последовательности промотора с заданной тканеспецифичностью. Ключевые слова: РНК-интерференция, РНК-полимераза III, промотор, факторы транскрипции, тканеспецифичность.