• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Применение генеративно-состязательных сетей глубинного обучения для выявления закономерностей во вторичных структурах ДНК

ФИО студента: Боровков Павел Вадимович

Руководитель: Попцова Мария Сергеевна

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2024

В рамках данной работы исследовалась возможность использования моделей глубинного обучения для генерации нуклеотидных последовательностей с определенными биологическими признаками. На протяжении исследования были независимо изучены как возможность непосредственно создавать цепочки ДНК, так и предсказывать их биологические свойства на основе имеющихся данных. Основной задачей работы было создать алгоритм расширения выборки данных генеративным путем без потери биологического смысла и оценить перспективность данного подхода. В основе моделей глубинного обучения, используемых в работе, лежит архитектура, основанная на принципе остаточного обучения, обученная с использованием нескольких методик и модификаций. В течение работы были обнаружены сильные и слабых стороны использования генеративного подхода, а результаты работы открыли дальнейшие возможности для исследования. Архитектура на основе ResNet, выбранная для изучения, хорошо показала себя как генеративный инструмент Была разработана модель, способная генерировать отрезки нуклеотидов с известными признаками, а также был реализован метод расширения выборки, позволивший улучшить качество предсказания существующей модели.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ