2023/2024
Введение в биоинформатику
Статус:
Маго-лего
Кто читает:
Базовая кафедра Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Когда читается:
1, 2 модуль
Онлайн-часы:
20
Охват аудитории:
для своего кампуса
Преподаватели:
Никулин Сергей Вячеславович
Язык:
русский
Кредиты:
3
Контактные часы:
6
Программа дисциплины
Цель освоения дисциплины
- Курс нацелен на изучение методов подготовки метагеномных проб и особенностей их анализа; математических подходов, лежащих в основе созданных специально для этого типа данных программных продуктов; вопросы секвенирования и сборки метагеномов‚ их аннотации и применения.
Планируемые результаты обучения
- Уметь осуществлять сбор и анализ информации с применением современных технических средств
Содержание учебной дисциплины
- Технологии секвенирования
- Контроль качества
- Сборка ДНК de novo
- Выравнивание коротких фрагментов
- Поиск и аннотация генов
Список литературы
Рекомендуемая основная литература
- Стефанов, В. Е. Биоинформатика : учебник для вузов / В. Е. Стефанов, А. А. Тулуб, Г. Р. Мавропуло-Столяренко. — Москва : Издательство Юрайт, 2023. — 252 с. — (Высшее образование). — ISBN 978-5-534-00860-9. — Текст : электронный // Образовательная платформа Юрайт [сайт]. — URL: https://urait.ru/bcode/511736 (дата обращения: 27.08.2024).
Рекомендуемая дополнительная литература
- Часовских, Н. Ю. Биоинформатика : учебно-методическое пособие / Н. Ю. Часовских. — Томск : СибГМУ, 2015. — 109 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/105971 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.