Бакалавриат 2024/2025

Биоинформатика

Статус: Курс обязательный (Когнитивная нейробиология)

Направление: 06.03.01. Биология

Кто читает: Базовая кафедра Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Где читается: Факультет биологии и биотехнологии

Когда читается: 2-й курс, 3, 4 модуль

Формат изучения: без онлайн-курса

Охват аудитории: для своего кампуса

Преподаватели: Жиянов Антон Павлович

Язык: русский

Кредиты: 6

Контактные часы: 84

Программа дисциплины

Аннотация

Биоинформатика — современное направление на стыке множества наук, в рамках которого биологические процессы и явления исследуются методами прикладной математики, статистики и информатики. Широкому развитию данной науки во многом поспособствовало появление биологических экспериментов, ручная обработка результатов которых не представляется возможной в виду огромного объема получаемых данных. В рамках первой части курса слушатели узнают о задаче выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и методах ее решения. Алгоритмы из данной области являются мощным инструментом как для эволюционной биологии и филогенетики, так и для решения частых технических задач (например, подбор праймеров для ПЦР). Во второй части курса слушатели узнают о способах обработки данных секвенирования нового поколения, на сегодняшний день являющегося одним из самых широко используемых методов. Будут разобраны идеи алгоритмов сборки геномов и картирования прочтений, а особое внимание будет уделено данным секвенирования РНК. Последняя часть курса будет посвящена алгоритмам машинного обучения и их применению в биомедицине (с акцентом на данные транскриптомного анализа).