Попцова Мария Сергеевна

Исследователи из НИУ ВШЭ разработали модель машинного обучения, которая предсказывает риск развития осложнений у пациентов, перенесших инфаркт миокарда. В модели впервые учли генетические данные, что позволило точнее оценить риск долгосрочных осложнений. Исследование опубликовано в журнале Frontiers in Medicine.

5–6 сентября прошел ежегодный междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2024». Он был посвящен проекту «Технологии машинного обучения в прогнозировании исходов острого коронарного синдрома», который реализуется в рамках зеркальной лаборатории.

С 19 по 29 августа Центр непрерывного образования факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ совместно с Институтом аналитического приборостроения РАН, Институтом спектроскопии РАН и компанией «Синтол» провел летнюю школу «Кардиогенетика: от секвенирования к разработке кардиопанели». Школа проводилась в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы (проект 15.ИП.21.0004).

В сентябре 2024 года сотрудники медико-генетического центра Genotek выступят преподавателями и руководителями курсовых работ и магистерских диссертаций на программе «Анализ данных в биологии и медицине» факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ. Экспертиза компании в анализе BigData и биоинформатической обработке данных секвенирования позволила переработать учебный план программы с учетом современных методов анализа данных в биологии и медицине.

«Рак должен быть побежден в XXI веке»

По приглашению Чукотского филиала в Анадырь Мария Попцова, заведующая Международной лабораторией биоинформатики Института искусственного интеллекта и цифровых наук факультета компьютерных наук Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики» г. Москва посетила г. Анадырь

Ученые Центра искусственного интеллекта НИУ ВШЭ зарегистрировали в Реестре отечественного ПО программное обеспечение, которое предсказывает расположение функциональных элементов генома методами глубинного обучения на основе омиксных данных молекулярной биологии. Программа востребована широким кругом пользователей – в первую очередь, в фармакологических компаниях – в задачах, требующих анализа омиксных данных или обучения нейросетей для улучшения геномной аннотации.

Российские и итальянские ученые запустили совместный проект по изучению функционирования генов в отдельных клетках глиомы, одной из форм рака мозга, а также микросреды, порождаемой этой опухолью.

В Высшей школе экономики прошла международная мини-конференция «Поиск новых путей развития российско-итальянского взаимодействия в сфере биомедицины». В ее работе приняли участие ученые из двух стран, а также ректор НИУ ВШЭ Никита Анисимов.

Ученые НИУ ВШЭ рассказали о зарегистрированных университетом интеллектуальных продуктах

Мария Попцова, Антон Воробьев выступали с докладом о прогностической системе ИИ для предсказания неблагоприятных исходов у пациентов с инфарктом миокарда

О кардиогенетике говорили с заведующей Международной лабораторией биоинформатики Марией Попцовой на радио Маяк

28 марта 2014 года в Высшей школе экономики начал работать факультет компьютерных наук. Его образовательные программы были сформированы с учетом опыта лучших университетов, а также наработок Школы анализа данных «Яндекса». Стратегической целью стало вхождение в топ-30 факультетов мира, готовящих разработчиков и исследователей в области компьютерных наук. Рассказываем, как развивался ФКН все эти годы и каких результатов удалось достичь.

Институт искусственного интеллекта и цифровых наук объявляет о запуске регулярного научного семинара по различным направлениям искусственного интеллекта. Первый семинар состоится 2 апреля и будет посвящен применению больших языковых моделей для анализа генома.

13 марта на ВДНХ в рамках Международной выставки-форума «Россия» прошел День искусственного интеллекта. НИУ ВШЭ — один из ведущих отечественных исследовательских и образовательных центров в сфере ИИ — принял участие в этом событии. Исследователи университета выступили в экспертных дискуссиях. Кроме того, проректор Вышки Сергей Рощин подписал Декларацию об ответственной разработке и использовании больших генеративных моделей.

В УЦ Вороново НИУ ВШЭ прошла ежегодная студенческая школа-конференция «Информационные технологии и системы. Биоинформатика» ИТИС(б), на которой приняли участие более 100 человек из ВШЭ, ИППИ РАН, Сколтеха, МГУ, МФТИ.

В начале февраля в Центре культур Вышки прошла Зимняя школа по аналитике и Data Science, организованная Центром непрерывного образования факультета компьютерных наук ВШЭ. В ней приняли участие более 400 слушателей. Доклады представили спикеры из «Яндекса», Сбера, МТС, «Дзена», «Авито», Альфа-Банка, Samokat.tech, Wildberries, Райффайзен Банка, а также сотрудники ФКН.

28 января в лектории Российского общества «Знание» на Международной выставке-форуме «Россия» на ВДНХ состоялись шесть лекций ученых НИУ ВШЭ. Пять из них были посвящены искусственному интеллекту, возможностям его использования в науке и повседневной жизни, шестая — особенностям научной коммуникации в современном обществе. Посетить лекции мог любой желающий.

25.01.2024г. сотрудники лаборатории приняли участие в научно-практической конференции «Татьянин день» – элементы искусственного интеллекта в современной гематологии»

The International Laboratory of Bioinformatics of the HSE Faculty of Computer Science and its partners in the Genetics of Cardiovascular Diseases Consortium are working on a new project titled ‘From Sequencing to the Development of a Cardiogenetic Test’ (in Russian). The Head of the International Laboratory of Bioinformatics, Maria Poptsova, talks about the project, the results obtained, and plans for the future.

Мария Попцова, заведующий международной лабораторией биоинформатики ФКН НИУ ВШЭ, выступила в эфире Радио Маяк в рубрике «Физики и лирики». «Разработки».

6 декабря Сбер провел R&D-день

30 ноября 2023 г. в Сургутском госуниверситете состоялся двухдневный II Международный форум геномных и биомедицинских технологий «От рождения до активного долголетия»

Международная лаборатория биоинформатики факультета компьютерных наук ВШЭ совместно с партнерами по консорциуму «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» ведет работу над новым проектом «От секвенирования к разработке кардиогенетического теста». О сути проекта, полученных результатах и планах на будущее рассказывает заведующая Международной лабораторией биоинформатики Мария Попцова.

Over three days, more than 300 conference participants attended workshops, seminars, sections and a poster session. During panel discussions, experts deliberated on the regulation of artificial intelligence (AI) technologies and considered collaborative initiatives between academic institutions and industry to advance AI development through megaprojects.

В течение трех дней более 300 участников конференции посетили тематические воркшопы, семинары, секции и постерную сессию. В ходе панельных дискуссий эксперты обсудили регулирование технологий искусственного интеллекта (ИИ) и то, какие мегапроекты могут делать университеты совместно с индустрией для развития ИИ.

The strategic session ‘Development of Cardiodiagnostic Products: From Sequencing to Medical Practice’ was recently held at HSE University. The event focused on identifying the market requirements for technology and products developed in the field of genetic testing for cardiovascular diseases.

В НИУ ВШЭ состоялась стратегическая сессия «Разработка и развитие кардиодиагностических продуктов: от секвенирования до медицинской практики». Ее целью было выявление требований к разрабатываемым технологиям и продуктам в области генетического тестирования сердечно-сосудистых заболеваний со стороны рынка.

28-29 сентября Международная лаборатория биоинформатики НИУ ВШЭ совместно с Научно-образовательным центром Медицинского института БУ ВО Ханты-Мансийского АО — Югры «Сургутский государственный университет» для целей реализации проекта «Зеркальные лаборатории» провели секционное заседание «Сердечно-сосудистый континуум: от ОКС до ХСН»

Один из проектов, победивших на конкурсе «Зеркальные лаборатории» НИУ ВШЭ в июне этого года, посвящен технологиям машинного обучения в прогнозировании исходов острого коронарного синдрома. Его реализуют Международная лаборатория биоинформатики НИУ ВШЭ и Научно-образовательный центр Медицинского института Сургутского государственного университета. Как зародился этот совместный проект, чем он поможет пациентам и как будет организована работа по его реализации, рассказывает заведующая Международной лабораторией биоинформатики, доцент ФКН НИУ ВШЭ Мария Попцова.

4-5 сентября в НИУ ВШЭ состоялся ежегодный Междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2023»

Недавно в Центре непрерывного образования факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ состоялась летняя школа «Кардиогенетика: отсеквенирования к разработке кардиопанели». Программа была организована совместно с Институтом аналитического приборостроения РАН,Институтом спектроскопии Российской академии наук и компанией «Синтол».

On August 28–30, HSE University’s Faculty of Computer Science held the 4th Summer School on Machine Learning in Bioinformatics. This year, 670 people registered for the event, and over 300 visited in person. The programme included lectures and seminars on various spheres of bioinformatics: applied bioinformatics and the bioinformatics of DNA, RNA, and proteins; elementary genomics; modern methods of data analysis and molecular biology. The lectures were complemented by practical tasks aimed at different levels of knowledge.

28–30 августа, накануне нового учебного года, факультет компьютерных наук ВШЭ провел четвертую летнюю школу по машинному обучению в биоинформатике. В этом году на событие зарегистрировались 670 человек, более 300 посетили ее очно.

В Центре искусственного интеллекта НИУ ВШЭ создали программное обеспечение для предсказания расположения элементов генома человека. Ученые использовали методы глубинного обучения на основе омиксных данных о различных молекулярных компонентах организма. Исследование выполнено в соответствии с задачами федерального проекта «Искусственный интеллект» национального проекта «Цифровая экономика».

На факультете компьютерных наук Вышки с 28 по 30 августа пройдет летняя школа по машинному обучению в биоинформатике. В течение трех дней участников ждут лекции и семинары от ведущих специалистов в данной области из ВШЭ, Сколтеха, AIRI, МГУ, МФТИ, Genotek, Sber Artificial Intelligence Laboratory.

В этом году Высшая школа экономики в четвертый разпроводила конкурс проектов «Зеркальные лаборатории». На конкурс было подано 19 заявок от 16 научных подразделений НИУ ВШЭ, партнерами которых выступили организации из 14 регионов России. По итогам конкурса было поддержано десять научно-исследовательских проектов, из них два — проекты ФКН.

В этом году Высшая школа экономики в четвертый раз проводила конкурс проектов «Зеркальные лаборатории». На конкурс было подано 19 заявок от 16 научных подразделений НИУ ВШЭ, партнерами которых выступили 16 организаций из 14 регионов России. По итогам конкурса было поддержано 10 научно-исследовательских проектов.

Они формируют Z-ДНК

Ежегодная Всероссийская научно-практическая конференция и 63-я сессия ФГБУ «НМИЦК им. ак. Е.И. Чазова» Минздрава России которая проходила в Чазовском Центре 6-8 июня 2023 года

26 – 28 мая 2023 года прошел выездной семинар академического кадрового резерва «Эффективная организация исследовательской деятельности и управление научной командой».

В журнале Life Science Alliance публикована статья «Open Access Z-flipon variants reveal the many roles of Z-DNA and Z-RNA in health and disease»

Опубликована статья в Журнале International Journal of Molecular Science

Чтобы повлиять на развитие эмбрионов

15 апреля в рамках Дней компьютерных наук состоялся ежегодный ИТ-девичник факультета компьютерных наук. В этом году мероприятиепрошло в партнерстве с Яндексом.

Вышла долгожданная публикация главы по DeepZ М. Попцовой и Н. Бекназарова в книге "Z-ДНК" Kyeong Kyu Kim, Vinod Kumar Subramani

16–20 февраля в Вороново прошла студенческая школа-конференция «Информационные технологии и системы. Биоинформатика» ИТИС(б). В ней приняли участие более 100 человек из ВШЭ, ИППИ РАН, Сколтеха, МГУ, МФТИ.

Победителями конкурсного отбора исследовательских проектов молодых ученых по тематике цифровых технологий и цифровой трансформации стали стажеры-исследователи Международной лаборатории биоифнорматики Константин Буркин и Александр Кирдеев

Мария Попцова рассказала о результатах работы в рамках проекта «ИИ в биоинформатике».

30-31 января 2023 г. г. в Московском физико-техническом институте прошла Международная конференция "Анализ Данных, Оптимизация и их Приложения"

Мир вокруг нас глазами ученого

Международная лаборатория биоинформатики приняла участие в школе для молодых ученых «Генетика и эпигенетика: механизмы, структура, функция», которая проходила на Биологическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова с 29 по 30 октября 2022 года.

Произошел квантовый скачок в создании научных зум-коллабораций во всем мире.

Between August 23rd and 25th, the HSE Faculty of Computer Science held its annual summer school on machine learning in bioinformatics. After two years of being held online, the school returned to an offline format for this year. Over three days, more than 120 participants attended lectures and seminars by leading experts in the field from institutions such as HSE University, Skoltech, AIRI, MSU, MIPT, Genotek, and Sber Artificial Intelligence Laboratory.

2 сентября в НИУ ВШЭ состоялось второе мероприятие консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» — междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2022», который продолжил работу консорциума между организациями, входящими в состав консорциума. В форуме приняли участие руководители и представители научных центров и институтов Москвы, Санкт-Петербурга, Новосибирска, Архангельска, Тюмени и Сургута.

На факультете компьютерных наук Вышки с 23 по 25 августа провели школу по машинному обучению в биоинформатике. Проект, два предыдущих года проходивший онлайн, был впервые реализован в очном формате. За три дня более 120 участников прослушали лекции и семинары от ведущих специалистов в данной области из ВШЭ, Сколтеха, AIRI, МГУ, МФТИ, Genotek, Sber Artificial Intelligence Laboratory.

25 мая 2022 года на факультете компьютерных наук прошла онлайн-конференция ABZ2022.

A team of researchers that includes experts from the International Laboratory of Bioinformatics of the Faculty of Computer Science, HSE University has presented a new way to fight melanoma. The scientists discovered that a form of DNA molecule entering cancer cells is able to induce an immune response similar to the body's response to a virus. As a result, the cells that support tumour growth are killed and the patient begins to respond to anti-cancer therapy again. The results of the study have been published in the Nature.

Коллаборация исследователей при участии специалистов Международной лаборатории биоинформатики факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ представила новый способ борьбы с трудноизлечимой меланомой. Ученые обнаружили, что одна из форм молекулы ДНК, попадая в раковые клетки, способна вызвать иммунный ответ, аналогичный реакции организма на вирус. В результате погибают клетки, поддерживающие рост опухоли, а пациент снова начинает реагировать на противораковую терапию. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature.

В журнале Nature 25 мая 2022 г. была опубликована статья «ADAR1 маскирует иммунотерапевтический потенциал рака при некроптозе, вызванном ZBP1» (ADAR1 masks the cancer immunotherapeutic promise of ZBP1-driven necroptosis) Александра Федорова, Назара Бекназарова, Алана Герберта, Марии Попцовой.

Завершающим мероприятием Дней компьютерных наук стал лекторий «Айти-суббота Вышки» в Культурном Центре ЗИЛ, который прошел 16 апреля.

В Центре искусственного интеллекта ВШЭ ведется работа по 25 направлениям. Группы ученых участвуют в конференциях и семинарах, пишут статьи, проводят воркшопы. Делать выводы и подводить итоги ещё рано, поэтому о промежуточных этапах и планах можно узнать из интервью с руководителями проектов.

Международная лаборатория биоинформатики приняла участие в Российском конгрессе по клинической фармакогеномике в Москве 4-5 февраля 2022

На конференции AI Community, которая в этом году состоялась в онлайн формате, выступали ведущие международные и российские эксперты в области ИИ, представители бизнеса.

Студент магистратуры «Анализ данных в биологии и медицине» Марк Гарницкий по программе мобильности уехал на год в Гентский университет в Бельгии. Мы попросили рассказать Марка о его пути на ФКН, участии в академической мобильности и социальной жизни во время пандемии.

Высокопроизводительные вычисления и большие данные, искусственный интеллект и нейросети, компьютерные симуляции, цифровые двойники и цифровые тени, виртуальная и дополненная реальность, интернет вещей, блокчейн и кибербезопасность — по таким трекам проходит работа Международного научного форума FIT-M 2021, организованного МИЭМ ВШЭ. В рамках его пленарных заседаний, сессий, реакторов, хакатонов поднимаются вопросы взаимодействия науки, образования, промышленности и бизнеса.

2 декабря 2021 г. в Сургутском госуниверситете при участии губернатора Югры Натальи Комаровой, а также директора окружного департамента образования и молодежной политики Алексея Дренина торжественно открылся I Международный форум геномных и биомедицинских технологий «От рождения до активного долголетия». Его организаторы – правительство округа, Фонд развития Югры и Сургутский госуниверситет.

AI Journey — это международная онлайн-конференция по искусственному интеллекту и анализу данных, организатором которой является Сбер. В этом году она прошла 10-12 ноября. Общее количество просмотров конференции на текущий момент уже превысило 50 миллионов.

В 2021 году факультет выпустил более 400 человек. При этом выпускники бакалавриата получили 29 красных дипломов, а выпускники магистратуры — 62. В этот раз мы поговорили с выпускниками многочисленных магистратур ФКН.

В начале сентября в НИУ ВШЭ состоялось первое мероприятие консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» — междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2021», который ознаменовал начало работы консорциума после подписания соглашения о научном сотрудничестве между организациями, входящими в состав консорциума. В форуме приняли участие руководители и представители научных центров и институтов Москвы, Санкт-Петербурга, Новосибирска, Архангельска, Тюмени и Сургута.

На факультете компьютерных наук НИУ ВШЭ завершилась вторая летняя школа по машинному обучению в биоинформатике, которая проходила 23-27 августа. В этом году школа собрала 533 участника из 53 стран.

В НИУ ВШЭ презентовали первый в России консорциум «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний»  на междисциплинарном форуме «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2021».  Цель консорциума — собрать централизованный и полный каталог геномных мутаций населения России.

Международная лаборатория биоинформатики приняла участие и выступила соорганизатором Московской конференции по вычислительной молекулярной биологии (Moscow Conference on Computational Molecular Biology) 30 июля - 02 августа 2021 в Сколтех

В интервью Forbes Woman Мария Попцова рассказала, как биоинформатика помогает лечить тяжелые болезни, включая коронавирус, и открывает перспективы продления жизни, кто в России финансирует подобные проекты и почему в отрасли актуальна проблема «утечки мозгов» за рубеж

19 мая 2021 года на факультете компьютерных наук прошла онлайн-конференция ABZ2021. В ней приняли участие более 200 ученых из 24 стран, в том числе генетики, молекулярные биологи, химики, биохимики, иммунологи, специалисты по структурной и клеточной биологии, а также специалисты в области машинного обучения.

The second issue of 2021 presents interviews about knowledge production and exchange from various angles.

25 января на факультете компьютерных наук открылась международная лаборатория биоинформатики. Главная научная цель лаборатории – определение роли альтернативных структур ДНК в функционировании генома.

02 февраля 2021 г. состоялся Круглый стол «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» в формате онлайн, посвященный генетике сердечно-сосудистых заболеваний, формированию консорциума по данному научно-исследовательскому направлению, подготовке к подписанию  соглашения о научном сотрудничестве.

Мария Попцова, заведующая лабораторией биоинформатики и доцент департамента больших данных и информационного поиска, выступила на конференции по искусственному интеллекту AI Journey 2020 с презентацией “Методы глубинного обучения в геномике”.

Ученые ВШЭ предложили способ повысить точность поиска Z-ДНК – участков молекулы, скрученных не вправо, а влево. Для этого они использовали нейросети и набор данных из более чем 30 тысяч экспериментов, сделанных разными лабораториями по всему миру. Подробности исследования опубликованы в журнале Scientific Reports.

Конкурс проектов «Создание международных лабораторий Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики» на период с 01.01.2021 по 31.12.2023» проводился с 15 июня 2020 г. по 15 декабря 2020 г.

Факультет экономических наук НИУ ВШЭ представляет серию вебинаров по экономике и данным здравоохранения

Научно-учебная лаборатория биоинформатики организовала первую международную школу по биоинформатике. Школа прошла 24-28 августа 2020 года в онлайн-формате.

Заведующая лабораторией Мария Попцова - гость радиостанции "Маяк"

Главный российский фестиваль любителей науки и технологий Geek Picnic впервые прошел в онлайн формате. Лекции от экспертов, мастер-классы, конкурсы и общение с единомышленниками – все, за что мероприятие любят поклонники, вошло в программу. Вышка в очередной раз выступила контент-партнером фестиваля.

Проектная группа – это инициативное объединение работников и/или учащихся от пяти человек и более постоянного состава для выполнения какой-либо проектной задачи с достижением значимого и понятного результата. Было подано 16 заявок на создание проектных групп работников, они были рассмотрены научной комиссией ФКН. Комиссия по поддержке образовательных инициатив рассмотрела 6 заявок от студентов.

Главный российский фестиваль любителей науки и технологий Geek Picnic впервые прошел в онлайн формате. Лекции от экспертов, мастер-классы, конкурсы и общение с единомышленниками - все, за что мероприятие любят поклонники, вошло в программу. Вышка в очередной раз выступила контент-партнером фестиваля.

Заведующая лабораторией Мария Попцова выступила на Geek Picnic 2020

11 апреля на факультете компьютерных наук состоялся первый день открытых дверей в новом формате.

Заведующая лабораторией Мария Попцова - участник и модератор круглого стола в рамках Зимней школы молодых ученых и врачей по фармакогенетике и персонализированной терапии

Заведующая лабораторией Мария Попцова выступила на Зимней школе по компьютерным наукам для поступающих в магистратуру

Заведующая лабораторией Мария Попцова - сопреседатель конгресса

С 7 по 10 февраля в Учебном центре Вороново состоялась Зимняя школа по компьютерным наукам для поступающих в магистратуру. В этом году было подано 123 заявки от студентов из различных регионов России и стран ближнего зарубежья. Из них отобрали и пригласили в Москву 45 лучших студентов.

Заведующая лабораторией Мария Попцова - лектор на Университетских субботах

Научно-учебная лаборатория биоинформатики факультета компьютерных наук совместно с ГБОУ ДПО Российской медицинской академии непрерывного профессионального образования Минздрава РФ стала организатором круглого стола «Пилотные проекты для исследования генетики сердечно-сосудистых заболеваний».

Заведующая лабораторией Мария Попцова - участник семинара

Сотрудники лаборатории - участники конференции

Сотрудники лаборатории - участники конференции

Сancer Сells Will Become Vulnerable